Modificările induse de antibioticele cu spectru larg pot produce un efect măsurabil asupra populației bacteriene colonice umane, cu efect imediat asupra stării de sănătate, iar proiectul „Modificări ale microbiomului uman în contextul stresului generat de antibiotice” își propune să stabilească impactul tratamentului cu antibiotice asupra microbiomului colonic uman. Despre proiectele realizate cu participarea Institutului Oncologic în cadrul programelor de cooperare ale Uniunii Europene a povestit Diana Simașco, specialist instituții publice, serviciul coordonare instituțională.

Ce activități pentru promovarea și sprijinirea cercetării și inovării realizează Institutul Oncologic?

IMSP Institutul Oncologic demonstrează o participare activă la Programele oferite de Uniunea Europeană, referitoare la valorificarea oportunităţilor de cooperare pe segmentul oncologic.

Astfel, întru promovarea și sprijinirea cercetării și inovării, în anul 2018, Institutul Oncologic în parteneriat cu Institutul Regional de Oncologie, Iași, au aplicat la apelurile de propuneri de proiecte pentru accesarea fondurilor în cadrul Programului Operațional Comun România-Republica Moldova 2014-2020 și, începând cu 10 octombrie 2020, pun în aplicare proiectul „Modificări ale microbiomului uman în contextul stresului generat de antibiotice”, cod EMS - ENI 2SOFT/1.2/105. Proiectul este finanțat prin intermediul Instrumentului European de Vecinătate (ENI).

În ce constă relevanța temei proiectului?

Modificările cotidiene ale hranei și administrarea oricărui produs chimic, în special a antibioticelor, vizează selectiv anumite populații bacteriene, producând modificări disbiotice, care se reflectă în dezvoltarea generală a speciilor bacteriene. Astfel de schimbări pot crea un mediu favorabil de evoluție a bacteriilor oportuniste, care pot deveni ulterior patogene.

Obiectivul nostru principal vizează evaluarea plasticității microbiomului uman după ce a fost provocat cu antibiotice, precum și capacitatea și gradul de recuperare după o astfel de intervenție. Acest proiect este organizat în concordanță cu strategia Organizației Mondiale a Sănătății pentru tratamentul cu antibiotice. În proiect sunt implicate două instituții oncologice, din regiunea de cooperare transfrontalieră care tratează patologii similare, dar au politici diferite legate de antibiotice. O practică neuniformă este o oportunitate în contextul proiectului nostru. În cadrul proiectului vor fi evaluați 470 de pacienți, ceea ce va permite demonstrarea influenței antibioticelor asupra microbiomului și va oferi posibilitatea de a evalua impactul direct al celor două abordări. De asemenea, vor fi create unități de biologie moleculară speciale pentru efectuarea secvențierii ADN-ului și de sporire a calificării profesionale. Pe baza noii tehnologii, ne propunem să producem o cooperare transfrontalieră de grup excelență pentru secvențiere paralelă a ADN. Ambele instituții medicale (parteneri) vor folosi echipamente de secvențiere ADN, astfel încât să creștem nivelul și calitatea de expertiză. Drept rezultat, crearea unei platforme comune pentru lucrări sinergice și cu protocoale compatibile.

La ce va contribui acest parteneriat transfrontalier, care va fi impactul?
Cooperarea transfrontalieră între IMSP Institutul Oncologic, Chișinău și Institutul Regional de Oncologie Iași va avea un avantaj imens. Principalul beneficiu pe termen lung al acestei cooperări este dezvoltarea a două laboratoare de cercetare și de diagnostic molecular superior, capabile să instruiască în continuare personalul privind tehnicile de secvențiere a ADN-ului metagenomic și acumulare de cunoștințe teoretice și practice privind tehnologiile NGS Ion Torrent și Illumina.

Dezvoltarea abilităților de cercetare în biologia moleculară va oferi posibilitatea de creare a două laboratoare majore orientate pe cercetare și diagnostic molecular, formând o structură cuprinzătoare capabilă să se înlocuiască și să se completeze reciproc. De asemenea, colaborarea transfrontalieră va oferi posibilitatea menținerii controlului asupra microbiomului intestinal pentru două populații diferite. După compararea efectelor diferitelor scheme antibiotice asupra microbiomului, pasul de viitor va fi evaluarea modificărilor pe termen lung ale microbiomului sub influența riscurilor factorilor clinici, ale malignității sau ale vârstei. Scopul proiectului constă în compararea diferențelor microbiomului din două populații care sunt expuse la diferite protocoale de antibiotice și să înțelegem mai bine impactul antibioticelor cu spectru larg ca o forță motrice pentru dezvoltarea rezistenței.

În ce constă proiectul și care sunt acțiunile de desfășurare a acestuia?
Obiectivul general al proiectului constă în crearea unei rețele comune, de cooperare transfrontalieră în cercetarea moleculară, axată pe stabilirea impactului tratamentului cu antibiotice asupra microbiomului colonic uman, pentru a crea o probă măsurabilă a modificărilor induse de antibiotice și a promova un nou protocol restrictiv pentru utilizarea antibioticului ca mod de a reduce costurile și de limitare a dezvoltării germenilor multirezistenți.

Proiectul are la bază două componente principale de acțiuni: analiza comparativă a schimbărilor microbiomului intestinal după diferite regimuri de antibiotice perioperatorii în două grupuri de studiu similare și crearea unui centru comun de excelență capabil să realizeze transferul de experiență în cercetarea moleculară și să genereze noi abordări de cercetare pentru stimularea dezvoltării economice și a inovării. Prin parteneriat transfrontalier două instituții medicale cu profil oncologic își propun să dezvolte o platformă comună pentru biologia moleculară, cu o structură și funcționalitate flexibilă. Instruirea întregului grup de cercetare științifică va promova flexibilitatea în cadrul fiecărui grup și în cadrul platformei comune.

Care sunt principalele grupuri țintă?
În primul rând, proiectul este orientat către cei 400 de pacienți internați pentru operații în spitalele partenere, IMSP Institutul Oncologic, Chișinău, și IRO Iași. 70 de pacienți vor fi testați de două ori la Iași și Chișinău pentru a valida metoda la ambii parteneri. Totodată, proiectul vizează cercetătorii care folosesc secvențierea ADN în IRO Iași și IMSP IO Chișinău – medici, biologi și bioingineri.

Care vor fi rezultate așteptate?
Proiectul prin obiectivele și rezultatele sale, va dezvolta două laboratoare de cercetare și de diagnostic molecular superior, dedicate diagnosticului și tratamentului oncologic. Rezultatele preconizate în urma derulării acestui proiect presupun validarea unei platforme comune pentru cercetarea biomoleculară, calificarea pregătirii personalului implicat în aceasta, un nou protocol pentru tratamentul profilactic cu antibiotice, inclusiv un raport privind modificările induse de antibiotice și răspunsul microbiomului colonic uman la diferite situații de stres. Proiectul „Modificări ale microbiomului uman în contextul stresului generat de antibiotice” va îmbunătăți condiția cadrului de inovare pentru acțiunile de cercetare transfrontaliere în domeniul microbiomului uman.

de Elena Roșca

Această publicaţie a fost produsă cu sprijinul Uniunii Europene. Conţinutul acestei publicaţii intră în responsabilitatea IMSP Institutul Oncologic şi nu reflectă în mod necesar poziţia oficială a Uniunii Europene sau a structurilor de management ale Programului Operaţional Comun România-Republica Moldova 2014-2020.